Toomas Siitan teeb teaduslikku koostööd Arvo Pärdi Keskusega 2023. aastast.
Toomas Siitan lõpetas Tallinna Riikliku Konservatooriumi (praegu Eesti Muusika- ja Teatriakadeemia) 1981. aastal heliloojadiplomiga ja kaitses doktorikraadi 2003. aastal Lundi ülikoolis. 1986. aastast õpetab ta muusikaajalugu Eesti Muusika- ja Teatriakadeemias (aastast 2004 professorina) ning juhatas 2013–2023 akadeemia muusikateaduse osakonda. Aastatel 2022–2024 oli ta Jāzeps Vītolsi Läti Muusikaakadeemia külalisprofessor. Siitani uurimisteemad on seotud lääne varajase kunstmuusika ajaloo ja esteetikaga, muusikaeluga Eestis kuni 20. sajandini ning Arvo Pärdi loominguga. Viimasest on ta lugenud kursusi nii EMTAs kui Tartu ülikoolis.
Toomas Siitan on olnud Eesti Muusikateaduse Seltsi esimees (1992–1997, 2003–2013), Eesti Muusikanõukogu aseesimees (1999–2017), Rahvusvahelise Hümnoloogiaühingu juhatuse liige (1993–2005), SA Eesti Kontsert nõukogu esimees ning on praegu muusikateaduse aastaraamatu Res Musica ja teadusväljaande „Eesti muusikalugu“ peatoimetaja. 1994. aastal asutas Toomas Siitan Haapsalu vanamuusikafestivali ja oli selle kunstiline juht kuni 2024. aastani.